ユーロフィンジェノミクス / ユーロフィンジェノミクス ID: J01934

プラスミド丸読みサービス ID: J01934

Oxford NanoporeTechnologies(ONT)の最新のロングリードシーケンステクノロジーを使用し、2.5kb~300kbの環状プラスミドDNAの全長配列決定とアノテーションを行います。

サービスについて

概要

Oxford NanoporeTechnologies(ONT)の最新のロングリードシーケンステクノロジーを使用し、
2.5kb~300kbの環状プラスミドDNAの全長配列決定とアノテーションを行います。
これまでサンガーシーケンスでは手間のかかっていたプラスミドの丸読みを、ぜひこの機会にお試しください。

特長

  • PCRによる増幅、シーケンスプライマー不要
  • GCリッチ、およびリピート配列に最適
  • ベクター配列を検証できる
  • プラスミドのカバレッジは平均100倍以上

サンプル調製

サンプルはヌクレアーゼフリーの水もしくは、10mM Tris-HCl(pH 8.5 )に溶解し、下記の濃度、容量にて1.5mLチューブにてお送りください。
サービス名 サイズ 濃度 最低容量
Regular 2.5~25kbp 30ng/µL 20µL
Large 25~125kbp 50ng/µL 30µL
XL 125~300kbp 50ng/µL 50µL
濃度測定の際には分光光度計による測定はせず、蛍光による測定法を用いてください。
分光光度計による方法では濃度が不足し、データが取れない場合がありますのでご了承ください。

納品物

  • データ分析レポート(HTML形式)
  • プラスミドアセンブル配列(FASTA 形式)
  • 注釈付きプラスミド配列(GENBANK 形式)(*1)
  • アノテーションテーブル
  • プラスミドアセンブル配列(*2)
  • 信頼性スコアを含む各塩基の品質
*1 シーケンスと特徴をSnapGene等のソフトウェアにインポートできます。
*2 SnapGene Viewer等のソフトウェアで表示することで、信頼性の低い位置をすばやく識別できます。
* 生データもご希望があればお送りすることが可能です。
* プラスミドマップとアノテーションテーブルは、アセンブル配列が2.5 – 50 kbの場合にのみ作成されます。
解析終了後に、結果送信先メールアドレス宛に、データを添付した結果報告メールをお送りいたします。
データ解釈ガイドはこちら

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

本サービスはプラスミドのサイズに合わせてRegular(2.5-25 kbp), Large(25-125 kbp), XL(125-300 kbp)の3つのサービスタイプがあります。
サービス名 サイズ 価格(税抜) 納期
Regular 2.5~25kbp ¥9,000 1~2週間
Large 25~125kbp ¥12,000 2~3週間
XL 125~300kbp ¥15,000

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