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アメリエフ / アメリエフ ID: J01954

シングルセルレパトア解析 ID: J01954

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細胞集団内の各細胞のトランスクリプトーム解析に加え、 T 細胞受容体 (TCR) や B 細胞受容体 (BCR) 遺伝子の配列を解析することで、T 細胞や B 細胞の多様性と動態をシングルセルレベルで解析できる最新の技術です。

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サービスについて

サービスの内容

【シングルセルRNAシーケンスおよびレパトア解析】
  • TCRまたはBCRレパトア解析と併せたシングルセル 5’RNA-seq
  • 10x Genomics社 Chromiumによるライブラリ調製
  • Illumina社 NovaSeq6000による3億リードのシーケンシング
  • Cell Rangerによる発現定量およびレパトアContigファイルの作成

【バイオインフォマティクス解析】（fig.1)
  • 解析レポート、中間報告および最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
    ・発現変動遺伝子の群間比較解析
    　細胞クラスターごとの特徴遺伝子検討、サンプル間発現比較解析
    ・レパトア解析
    　　多様性解析、Expansion Cloneの発現パターンの解析、クラスタごとのクローン数解析


    • fig.1 バイオインフォマティクス解析

    ご利用の流れ（fig.2）


    fig.2 ご利用の流れ
    1. 研究目的、サンプル情報をヒアリングし、お見積りを作成します。
    2. ご発注後、サンプルを準備いただき、シーケンスを行います。
    3. 中間報告会にて、途中結果の報告および解析方針の確認、内容についてのディスカッションを行います。
    4. 最終報告会にて、結果の報告および内容について、ご報告します。

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ：細胞
・凍結状態であること。
・細胞数は106細胞以上であること。
・融解後の細胞の生存率が90%以上推奨。
・細胞は分散もしくは単離してください。
・細胞培養に最適化された培地に懸濁してあること。
・細胞サイズが直径30μm以下であること。
・40μmのフィルターにかけてください。
・凍結の際にはセルバンカー等を用いてください。
　＊ ヒトおよびマウスサンプルのみの対応となります。
　＊ 納品にかかる費用 (クラウドまたはHDD) を別途頂戴します。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目 価格（税抜） 納期
シングルセルレパトア解析 お問い合わせ お問い合わせ

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  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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