KOTAI バイオテクノロジーズ / KOTAI バイオテクノロジーズ ID: J01929

シングルセル遺伝子発現Flex ID: J01929

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ホルマリン固定した組織や細胞のｍRNAをプローブを用いて検出し、遺伝子発現解析をシングルセルレベルで実施するアプリケーションです。

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サービスについて

概要

シングルセル遺伝子発現Flexは固定した細胞に異なるバーコードがついたプローブをハイブリダイゼーションし、このプローブを検出することで多検体の同時解析が可能なサービスです。従来のシングルセル解析では難しかった凍結組織やFFPEブロックからのシングルセル解析や、壊れやすい細胞やターンオーバーの早い細胞にも対応できます。また、多検体を同時に解析することができるプローブを採用しており、サンプルあたりのコストが下がりリーズナブルな価格でのご提供が可能となりました。（fig.1）（fig.2）

fig.1 Fixed RNA プロファイリングの原理

fig.2 シングルセル遺伝子発現Flexのワークフロー

特長

凍結組織やFFPEブロックからシングルセル解析が可能に
細胞・組織を固定することで、解析したいタイミングを逃さない！
Multiplex解析で検体あたりの費用を抑えつつ、多検体解析に対応

解析例（fig.3）（fig.4）

Cellrangerによる解析結果をLoupe Browser 8.0で開いたところ。

fig.3 固定組織解析例（マウス大脳）

fig.4 FFPE組織解析例（マウス大脳）

解析可能なサンプル

サンプル	凍結細胞、凍結組織（＊）、固定細胞、固定組織、ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）サンプル
動物種	ヒトまたはマウス
解析メカニズム	全トランスクリプトームパネルのそれぞれの標的遺伝子に対するプローブを使用して発現遺伝子を検出する
サンプル受け入れ条件	詳細情報ページ参照

＊凍結組織は液体窒素気相保管が推奨されています。-80℃で保管された組織はmRNAの品質が低下します。
　組織の液体窒素保管が難しい場合はあらかじめ固定した上で-80℃で保管することをお勧めします。

納品物

KOTAIバイオテクノロジーズ社がシーケンスを行う場合	Fastqデータ Cell Ranger解析結果 - Web Summary - cloupeファイル - Matrixファイル - csvなど情報シート（解析方法や使用試薬などをまとめたもの）実験情報まとめ（細胞数や生存率cDNAやライブラリの測定結果）
お客様がシーケンスをされる場合	ライブラリー情報シート実験情報まとめ

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

受託内容	価格（税抜）	納期
Flex（Fixed RNA Profiling）	1サンプル：￥880,000 4サンプル：￥1,720,000	6週間

＊細胞種や解析内容によっては、上下することもございます。
＊他サンプル数の場合、お問い合わせください。

オプション	価格（税抜）
細胞固定	サンプル当たり￥45,000
組織分散（10x試薬固定）	サンプル当たり￥40,000
組織分散（FFPE）	サンプル当たり￥64,000
全血固定（PBMC、白血球）	サンプル当たり￥12,000

受託オンラインCommissioned Research Online四国理科株式会社 四国理科株式会社