サービス仕様
Total RNA-seq（lncRNA を含む全トランスクリプトーム解析）
全トランスクリプトームを探索することで潜在的な転写調節のメカニズムについての洞察が得られる手法です。
トランスクリプトーム全体の配列を決定し、特定の状況下で生物学的サンプルに存在する mRNAや long
non-coding RNAを含む完全な RNA のセットを記録することができます。
mRNA-seq
特定の環境下で生物学的サンプルに存在するコーディング RNAを効率的に検出し、正確に定量するために選択
される方法です。
転写物の存在量を正確に推定することで、発現変動解析が可能になります。
お客様のご注文後、サンプル送付から処理、データ取得、解析を包括的にサポートします。
特長
Total RNA-seq
- rRNA の除去を実施後、コーディング／ノンコーディング RNAの検出
- クロマチンリモデリング／転写・転写後調節に関わる non-coding RNAの検出
- 多様なサンプル量に対応
- 新規転写産物や新規スプライシングイベントの検出
- FFPEサンプルに対応
mRNA-seq
- Library complexityを重視し、転写産物を高いカバレッジで検出
- 遺伝子発現レベルの正確な比較が可能
- 多様なサンプル量に対応
各解析の流れ
Total RNA-seq（lncRNA を含む全トランスクリプトーム解析）
コーディング・ノンコーディング RNAを含むライブラリーを作成してシーケンスします。
lncRNAの解析を通じて遺伝子構造・転写後発現調節・クロマチンリモデリングなど幅広い研究に
ご利用いただけます。
Step 1: RNA 品質チェック
- RIN value（RNA integration number）測定
- RNA 濃度測定
Step 2: ライブラリー調製
- rRNA 除去
- ストランド特異的にライブラリー調製を実施
- シーケンシング前にライブラリーチェック実施
Step 3: シーケンシング（Illumina社プラットフォーム使用）
- PE50、1サンプル当たり約5,000万 raw read取得
mRNA-seq
polyA選択された RNAを含むライブラリーを調製してシーケンスする手法です。幅広いインプット量に対応し
ます。
Step 1: RNA品質チェック
- RIN value（RNA integration number）測定
- RNA濃度測定
Step 2: ライブラリー調製
- PolyAセレクションによるmRNA精製
- ストランド特異的にライブラリー調製を実施
- シーケンシング前にライブラリーチェック実施
Step 3: シーケンシング（Illumina社プラットフォーム使用）
・PE50、1サンプル当たり2,500～3,000万raw read取得
バイオインフォマティクス解析
多彩な追加解析オプションを取り揃えています。
スタンダード解析
リファレンスゲノムへのアラインメント、トランスクリプトーム発現量算出
アドバンス解析
- 示差解析
- 示差遺伝子のアノテーション
- 主成分分析
- GO解析
- パスウェイ解析
解析のカスタマイズ：マルチオミクス解析、機械学習解析など上記にない解析法をご希望の場合はご相談ください。
